2018年7月1日，拜仁慕尼黑宣布以自由转会方式签下莱昂·格雷茨卡，彼时他与沙尔克04的合同刚刚到期。八年后，2026年7月1日，在为拜仁出场312次之后，格雷茨卡合同期满离开。
尽管为拜仁这样级别的俱乐部出场超过三百次，且是更衣室里的宠儿，但他在球迷心中留下的遗产却相当复杂。可以说，在合适的体系下，格雷茨卡曾是顶级中场之一，甚至在某些时刻成为拜仁运转的关键齿轮——这在如今对他的普遍评价中简直难以置信。然而，当环境并不完美时，问题便随之浮现。
格雷茨卡2018年夏天抵达慕尼黑时承载着全德国的期望，他被视为德国“1995级”新星中的佼佼者，同届还有勒鲁瓦·萨内、塞尔日·格纳布里、尼克拉斯·聚勒以及约书亚·基米希。在拜仁的首个赛季，他的表现稳定但并未真正令人惊艳。他似乎满足于在 midfield 充当角色球员，让蒂亚戈·阿尔坎塔拉在拖后位置获得更多创造自由——这恰恰是当时拜仁所需，就像哈维·马丁内斯曾解放施魏因斯泰格那样。然而讽刺的是，在欧冠赛场马丁内斯仍是更受青睐的选择。这很可能是因为尼科·科瓦奇要求不高的进攻组织需要马丁内斯这样的经验球员来建立连贯结构，而这对刚加盟的23岁格雷茨卡来说要求过高。
值得注意的是，整个赛季格雷茨卡一直受到小伤困扰。这些伤病在2019/20赛季初期仍有显现，但大部分时间已无大碍，使他逐渐成为球队重要一员，帮助球队在各项赛事推进——此前一个赛季拜仁已赢得国内双冠。
2019年11月，科瓦奇下课，汉斯·弗利克接手。格雷茨卡起初只是零星首发，因为弗利克和科瓦奇一样确立了基米希+蒂亚戈的双后腰。但本杰明·帕瓦尔的受伤迫使基米希回到右后卫位置，格雷茨卡得以与蒂亚戈搭档首发后腰。与科瓦奇时期不同的是，他回到了更接近沙尔克时期的角色：B2B中场而非严格意义上的后腰。这变化在新冠疫情停摆后变得尤为理想，因为格雷茨卡在此期间大幅增加了肌肉量。
增肌后的格雷茨卡明显不如以前灵活，但中路存在感大幅提升，使他成为无球状态下的重要棋子。他利用在中路制造控制区域的能力，帮助弗利克的高位逼抢体系运转：格雷茨卡通常负责拦截穿透第一道防线的传球，或直接上抢持球人。然而，弗利克体系的强度加上格雷茨卡的大体重，对他的身体造成了巨大消耗，直到多年后人们才真正意识到这一点。