在温布利大球场的联赛杯决赛中，约翰·斯通斯戴上了曼城的队长袖标。然而，或许正是曼城上一次造访这座国家体育场的经历，预示了他在伊蒂哈德球场的十年生涯即将画上句号。当时，瓜迪奥拉已经因资格问题缺少了马克·格希，又因伤失去了约什科·格瓦迪奥尔。随后，鲁本·迪亚斯因腿筋问题被排除在外。在缺少三名中卫的情况下，斯通斯的第六中卫顺位被彻底确认——内森·阿克搭档阿卜杜科迪尔·胡桑诺夫首发出战。这与三年前那场决赛形成了鲜明对比。彼时，斯通斯在欧冠决赛中完成了自梅西以来单场最多的过人次数，六次过掉国际米兰的防守球员。2023年，他表现得极具毁灭性；而到了2026年，他将在合同今夏到期后离开曼城。可能性更大的解释是，瓜迪奥拉放弃的不是斯通斯的天赋，而是他的身体。近些年来，曼城——或许也是瓜迪奥拉——做出过不少不再给凯文·德布劳内、塞尔吉奥·阿圭罗等非凡球员提供新合同的决策。这有时是一种不带感情色彩的选择，但斯通斯在伊蒂哈德的十年里，健康状况始终是个问题。
本赛季，斯通斯仅在联赛中首发了四场，且没有一场是在十月之后，曼城在这四场比赛中输掉了三场。2026年至今，他仅出场三次，全部发生在足总杯。一月，曼城签下了他的英格兰国家队搭档格希——另一位擅长脚下控球的中后卫，这标志着球队正在从斯通斯时代过渡。在瓜迪奥拉麾下，没有哪位中后卫比这位从埃弗顿以4750万英镑签下的球员出场更多；然而，斯通斯本可以拥有更多的比赛机会。自从加盟以来，他在375场英超比赛中仅首发了148场。贝尔纳多·席尔瓦比他晚一年到来，但已在各项赛事中为曼城多出场了161次。
斯通斯并非一位“常客”，但瓜迪奥拉曼城的一些标志性元素却围绕着他展开。2016年12月，在他尴尬的首个赛季中，杰米·瓦尔迪带领莱斯特城4比2击败曼城，斯通斯在防守瓦尔迪时步履维艰。赛后瓜迪奥拉说出了那句著名的自白：“我不是一位擅长抢球的教练。”斯通斯被视为瓜迪奥拉的典型球员；然而在2017-18赛季百分夺冠的曼城阵中，尼古拉斯·奥塔门迪才是中卫位置的绝对主力；而在2018-19赛季的三冠王冲刺阶段，文森特·孔帕尼取代了斯通斯，成为艾默里克·拉波尔特的搭档。但正是斯通斯，或许在英超历史上最激烈的冠军争夺战中做出了决定性贡献——他的一次门线解围，皮球距离越过门线仅有11毫米，这最终成为了曼城与利物浦（98分对97分）之间的分水岭。
斯通斯在2019-20赛季陷入挣扎：拉波尔特受伤、孔帕尼离队且没有补充新援，但他却在欧冠被里昂淘汰的比赛中沦为替补未登场，尽管瓜迪奥拉当时派上了三名中后卫。那成了瓜帅最差的阵容选择之一。然而，他做出了回应，2020-21赛季堪称斯通斯在曼城的第二佳赛季——那又是一个他传球成功率保持在百分之九十几的赛季。这也凸显了一个主题：尽管伤病打断了他的曼城生涯，但英格兰队是幸运的，他在2018、2021、2022和2024年连续四届大赛中保持健康并表现出色。
斯通斯在曼城的标志性赛季是2022-23赛季。正是在那时，“约翰尼·约翰尼·斯通斯”成为了球迷的赞歌，瓜迪奥拉对技术型球员的偏爱以及对球员进行重新塑造的意愿，使斯通斯成为关键战术变革的一部分，最终帮助球队征服了欧洲。他在职业生涯早期曾被戏称为“巴恩斯利的贝肯鲍尔”。瓜迪奥拉为这个绰号注入了实质内容，让斯通斯带球出防守区、游走至中场，使曼城在人数上占据优势。此后，这种既是后卫又是中场的混合角色从未被真正成功模仿，这或许也说明了其完美执行的难度以及斯通斯技术特点的独特性。
随后的一个赛季同样证明了这一点。在伯纳乌3比3战平皇家马德里的比赛中，斯通斯在下半场移师中场。他表现极其出色，堪称全场最佳，即便是在不熟悉的位置上。这就是曼城会记住的斯通斯；但这也是曼城越来越无法依赖的那个斯通斯。他在三个赛季中仅在联赛中首发了22场。正是这些伤病，促使曼城在今年一月转会市场上迅速签下了胡桑诺夫和维托尔·雷斯。斯通斯只有31岁，但身体状态的下滑已不容否认。